引起肺性脑病的根本原因是肺部的原发疾病，肺部的原发疾病加重会引起继发的肺性脑病。因为肺是调节二氧化碳和氧气的很重要的脏器，身体产生的二氧化碳通过肺排出，从外界吸收氧气来提供身体的需要。如果肺遭受到了不可逆的改变，可能影响二氧化碳的排出，影响氧气的摄入，而影响身体内的酸碱平衡。所以酸碱失衡、二氧化碳程度的高低、缺氧程度，这三者都可引起中枢神经系统的损害，同时可以引起肺性脑病。总结一下，肺性脑病根本原因就是肺部的疾病没有得到很好的控制，而继发所引起的。
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