感染EB病毒的人群非常普遍，但多数感染者并不发病，呈携带者状态，人体感染EB病毒后一般没有明显的症状。如果有症状，可以出现全身各系统的症状，临床表现复杂多样，起病缓急不一。常见的症状包括持续发热，体温可在38.5~40℃之间，局部可以出现皮疹、肝脾肿大、肝功能异常，甚至可以出现黄疸、全身淋巴结肿大。半数患者还会出现咽痛，咽部扁桃体会出现充血、水肿，甚至黏膜会出现溃疡，引起咽痛、恶心等症状。还可能导致眼结膜充血、鼻出血，以及神经系统、呼吸系统、心血管系统的表现。
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