鼻拭子和咽拭子区别主要在于留取标本位置不一样。咽拭子是在咽部，鼻拭子需要到鼻腔里，不是外鼻腔，是需要用比较长的拭子，缓缓旋转送到鼻腔深部，所以取材的部位不一样。 拭子的材质也不一样，鼻拭子情况特殊，材质比较软，便于通过鼻腔到达鼻腔深部，过程可能比咽拭子时间长。 鼻拭子部分患者同时患会觉得更痛苦，因为鼻腔结构有时候会有鼻甲肥大、鼻中隔偏曲等，会导致取材过程中摩擦力更大，更加痛苦。
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