脑脓肿与脑疝有密切的关系。有些脑脓肿体积比较大、占位效应明显，会引起明显的、严重的水肿。并且脓肿会压迫引流静脉，影响大脑的血液回流。这种情况下，会导致严重的颅内高压现象，并且有可能引起脑疝。出现脑脓肿并且引起脑疝的情况时，需要紧急的处理。同时做好手术准备，紧急的行脑脓肿切除以及去骨瓣减压的手术。手术后给予抗生素、抗感染以及改善脑水肿的治疗，才有可能挽救回患者的生命。
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