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疟疾的潜伏期因为感染的疟原虫的不同而不同。疟疾是由于人类感染疟原虫导致的一种寄生虫疾病，患者感染的疟原虫一般分为间日疟、卵形疟、三日疟和恶性疟，每种疟原虫引起疟疾的潜伏期不一样。间日疟和卵形疟潜伏期一般是3~15天，即2周左右的时间。而三日疟潜伏期是相对最长的，一般是24~30天。恶性疟相对引起病情最重，而且基本上所有因疟疾死亡的患者都是恶性疟感染导致。但恶性疟潜伏期一般是最短的，可以7~12天。它导致的发热是没有明显的规律，可以导致多个脏器的损伤，且致死率较高。
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