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宝宝肠炎恢复的时间一般与感染的病原体，以及病情的轻重有很大关系。
如果没有明显的感染中毒症状，也没有明显的脱水、电解质平衡的紊乱，仅有轻微的胃肠道症状，并发症较少。
一般给予饮食调整，针对病因治疗，如微生态调整，黏膜保护剂的应用，使用敏感的抗生素等治疗后，一般3~8天就能够好转。
重症的肠炎，包括重症的水样泻的婴幼儿，常常会伴有严重的脱水、电解质紊乱，甚至是休克，痊愈需要的时间可能达到或超过2周。
少部分合并营养不良及营养素缺乏的婴幼儿，可以转为慢性迁延性腹泻，恢复的时间需要更长。
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