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肛瘘是肛门和肛管之间形成的病理性管道，有原发性内口、瘘管，继发性性瘘管及外口。肛瘘需要具备内口、外口和瘘管，还有内盲瘘和外盲瘘。发病原因往往是由于齿线位的肛腺感染造成细菌繁殖，沿着肛腺的走形穿越括约肌，造成肛周皮下，肛周括约肌的不同层次、不同的间隙，形成脓肿，穿破皮肤形成瘘管。所以，肛瘘的前期是一个脓肿的过程，就是肛周感染。临床上分期分低位肛瘘和高位肛瘘，低位肛瘘也分低位单纯性肛瘘低位复杂性肛瘘。高位肛瘘是单纯性肛瘘和复杂性肛瘘，治疗方法，需要外科手术治疗才能痊愈。
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