儿童类风湿性关节炎的病因和发病机制，尚不明确。经过研究发现，可能有遗传的背景，潜在的遗传易感性，可能比较容易得幼年类风湿性关节炎。有些患儿可能在患病前，有呼吸道感染、消化道感染或泌尿系统感染，可能感染激发免疫紊乱，最后导致儿童类风湿性关节炎。自身免疫紊乱，有的患儿可能就产生抗体，会对关节、组织造成破坏，从而会出现儿童类风湿性关节炎。
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