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确诊流行性出血热，要结合患者的流行病学史、临床表现，以及相关实验室检查等综合分析、判定确诊，同时要排除其他疾病的可能。如果是非疫区的患者或者不典型的病例，可以经过特异性的血清学诊断进行确诊。 流行性出血热主要表现有发热、三痛、三红，也就是头痛、腰痛、眼眶痛，面部、颈部和上胸部发红。血中白细胞总数及中性粒细胞百分比显著升高，血小板减少，尿中有蛋白甚至形成膜状物，血清中流行性出血热病毒IgM抗体阳性。
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