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百日咳是百日咳杆菌传染引起的传染性疾病，人群是百日咳普遍易感的，婴儿是高发人群，小于6个月婴儿发病率明显高于其他年级组。
因为接种了百日咳杆菌，对百日咳有免疫力的原因，从潜伏期末期1~2天，到发病的6周内均有传染性，以及以1~3周传染性最强。所以一般发病两个月内，没有咳嗽症状是没有传染性的。
传播途径主要是通过患儿或者是潜伏期患者，在打喷嚏或者咳嗽时，喷嚏、飞沫中含有病毒，病源会通过飞沫传播。易感人群吸入带病毒的飞沫后会被传染，百日咳杆菌在体外的生存能力比较弱，间接传播的可能性比较少。
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