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患者感染了嗜水气单胞菌之后常会导致急性肠胃炎，大部分呈自限性，可以不做抗生素治疗。
如果患者自身抵抗力低下，并有多种基础疾病、腹泻症状明显或者出现了肠道外感染的症状，可以采取诺氟沙星、复方新诺明等药物进行治疗。如果患者出现了局部感染的病灶，应及时的切开排脓。另外对嗜水气单胞菌敏感的药物还有妥布霉素、庆大霉素、氟哌酸、卡那霉素等，具体用药应该在医生指导下进行。
患者出现嗜水气单胞菌感染之后，还可能会导致引发腹膜炎、败血症、脑膜炎、尿路感染、胆囊炎、肺炎等病症。
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