先天性的睾丸萎缩属于男性生殖器畸形,而因疾病导致的继发性睾丸萎缩不属于生殖器畸形。
男性生殖器畸形包括睾丸畸形、输精管畸形、阴茎异常以及前列腺、精囊腺先天畸形。睾丸畸形又包括无睾症、单睾丸、多睾丸、睾丸先天萎缩、发育不全以及睾丸畸胎瘤。输精管畸形又会分为先天性的缺失、重复输精管以及与输尿管相交通等多种情形。
阴茎异常则会分为大小异常和位置异常的情况,大多是和其他的畸形一起出现,例如阴茎完全缺失,这种情况大多会和尿道畸形合并。
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